中研院調查發現，綠島北部柴口、公館海域超過百分之十的石珊瑚群得了「黑病」死亡，上面被類似海藻的不知名深墨綠色海棉體形同薄膜覆蓋。主持調查的研究員鄭明修說，這是台灣發現珊瑚群莫名死亡的第一例。
鄭明修說，被覆蓋死亡的石珊瑚群，多數分布在排水溝出海口三公尺至七公尺深海域，因兩地在綠島民宿、餐廳、飯店集中區的公館及中寮村附近，研判可能與廢水汙染有關。
鄭明修解釋，珊瑚「黑病」與白化不同，白化的珊瑚是附著在珊瑚的單細胞共生藻，因水質惡化等原因離開，珊瑚並未死亡，仍有回復原貌的可能，黑病則是珊瑚已死。目前黑病死亡的石珊瑚面積難以估算，大致每一百公尺即有超過十公尺的石珊瑚染病，情況嚴重。
綠島西部石朗海域及南部大白沙海域，過去即發現珊瑚群因水質惡化出現白化現象。去年珊瑚礁學會在綠島做珊瑚總體檢，發現綠島北部柴口、公館海域的石珊瑚得了「黑病」死亡，類似藻化。至今，黑病持續感染柴口、公館海域的其他石珊瑚，專家束手無策。
長期研究珊瑚礁生態的中研院研究員鄭明修說，「黑病」是指珊瑚體被一種不知名的深墨綠色海棉體覆蓋，這一不知名的海棉體觸摸類似薄膜，檢驗含有藍綠藻成份，但不確定是否是藻類。
專家不解，這種不知名海棉體只覆蓋在石珊瑚上，水脊珊瑚及軟珊瑚皆未受影響。專家目前還無法確知，死亡的石珊瑚是被這種不知名的海棉體覆蓋而死，或死後被覆蓋，也不知道海棉體從何而來。
東部海岸國家風景區管理處得曾請專家、學者監測調查，仍無法確定海棉體來源。目前中研院研究員陳昭倫、中山大學海洋所教授宋克義、台大海洋所教授戴昌鳳等專家已展開調查，希望找出原因。
